“十三五”是我国全面建设小康社会的决胜阶段，也是全院建成世界一流农业科研院所的关键时期。

“十三五”时期，全院的发展思路是：深入贯彻党的十八大及十八届三中、四中、五中全会精神，以创新、协调、绿色、开放、共享发展理念为统领，面向世界农业科技前沿，面向国家农业产业发展，面向“三农”建设主战场，坚持“建设世界一流农业科研院所”的发展目标，坚持“顶天立地”的发展方向，全面贯彻落实创新驱动发展战略，突出国家需求导向，聚焦提升自主创新能力，聚焦支撑农业经济发展，聚焦国家发展重大需求，着力加快关键核心技术突破和成果转化应用，着力推进体制机制创新和现代院所发展，着力抓好人才团队和作风建设，提高科技创新供给的质量和效率，突出科技创新在供给侧改革中的引领作用，不断催生农业发展新的增长点，显著提高农业的科技含量和核心竞争力，彰显国家队的实力和影响力，全面带动我国农业科技整体实力率先进入世界先进行列。

发展目标是：到2020年，初步建成世界一流农业科研院所，成为强力支撑我国世界农业大国地位的农业科研国家队。农业科技前沿领域和产业发展核心技术取得重大突破，产生一批世界级水平、具有革命性影响的重大科技成果；体制机制创新取得重大突破，形成定位准确、布局合理、协同创新、运行高效的现代农业科研院所体系；高层次人才队伍建设取得重大突破，聚集和打造一批国际知名科学家和青年英才，1/3研究所、学科领域和创新团队进入世界一流，1/3达到国内一流。通过“十三五”的发展，进一步彰显中国农科院在我国农业科技发展中的主导作用，在解决我国农业产业发展中全局性、战略性、关键性科技问题的核心作用和国际农业学术界的引领作用。

重点任务是：一是着力推进体制机制创新。充分发挥改革排头兵的作用，以科技创新工程为抓手，继续在科研组织、管理等领域先试先行，破解发展中的体制机制难题。大力优化资源配置，在重要领域和关键环节取得新的进展。构建符合农业科研规律、职能定位清晰的院所治理结构，加快建立“定位明确、法人治理、管理高效、开放包容、评价科学”的现代院所制度。二是着力突破重大关键核心技术。力争在重大基础和前沿技术探索、重大农业生物品种创制、绿色增产增效技术体系构建、智能化农业设施装备研制、农业资源高效循环利用与环境保护、重大病虫害防控技术体系构建和农业大数据关键技术研究等方面取得突破。建立具有全院特色的重大成果培育体系，加强高水平论文、重大品种、重大专利、重大产品、重大奖励的培育力度，显著提升创新能力和影响力。三是强力支撑产业发展。持续开展绿色增产增效技术集成模式研究与示范，创新农业科技成果转移服务体系和模式，建设完善高水平的农业成果转化与展示示范基地体系。创新资产管理模式，建设院农业科技产业孵化中心，打造一批具有核心竞争力的兽用生物制品、种业农化、特色农产品等高科技支柱产业群。建设国家农业智库，开展国家农业和科技发展重大战略与热点问题研究，提高全院在重大政策建议、重大战略咨询上的话语权、影响力和权威性。四是着力打造人才建设高地。创新科技人才定向引进机制，形成更加有利于人才集聚和成长的政策环境，激发创新活力和创新潜能。完善科技人才培养开发机制，在“青年英才计划”内设置科研、管理、支撑和转化英才培育工程，全面推进四支队伍协调发展。坚持以全日制研究生教育为主，专业学位教育、留学生教育和国际联合培养为辅的多元化发展战略，不断扩大招生规模，提升培养质量，努力把研究生院建设成为高层次、研究型、国际化、有特色的人才培养基地。五是着力优化科研布局和平台建设。逐步实现全院在全国农业生态区域、农业学科领域的机构与力量覆盖，形成区域布局合理、主攻方向清晰、优势特色鲜明的研究所战略格局。筹建一批国家重大科技基础设施，加强重点实验室建设，完善试验示范基地布局，构建装备先进、运转高效、国际一流的重大科技平台体系，显著提升科研平台的信息化、智能化水平。加强与区域内涉农科研机构和高校的合作，谋划区域性综合研究中心建设，实现与区域经济发展的有效对接和深度融合，提升全院对区域农业发展的引领与支撑作用。六是着力推进全球农业科技战略。优化国际合作重点区域和领域，通过在全球代表性国家或国际组织建立联合实验室、试验示范中心等方式，形成多双边及区域合作的新格局。服务国家整体外交战略，积极参与“一带一路”、农业“走出去”战略框架下农业科技合作发展规划、行动计划的研究与编制。建设“海外农业研究中心”，构建全院农业科技“走出去”战略组织协调体系。积极谋划“以我为主”的重大国际农业科技合作计划，强化前沿技术旗舰项目合作，占领国际学术新高地。