2016年1月22日，农业部沼气科学研究所组织邀请了中国农业科学院薛亮研究员、中国农业科学院创新工程管理办公室董照辉副研究员、四川大学杨志荣和张文学教授，同济大学朱洪光教授、中国科学院成都山地灾害与环境研究所王玉宽研究员、四川农业大学伍钧教授等专家，开展了2015年科技创新工程试点期团队绩效考评工作。

专家组听取了能源微生物、种植业废弃物能源化利用、畜禽粪污沼气化处理利用、农产品加工废弃物沼气化利用、农村生活废弃物分散处理和农村生物能源发展战略与技术模式等六个创新团队首席专家的汇报，查阅了相关资料，并对相关问题进行了质询，专家组一致认为，沼气所及六个科研团队均达到试点期考核目标。认为沼气所科技创新工程试点期间，学科布局合理，团队组建基本到位，研究方向明确、定位准确，科研选题符合国家产业发展需求，并具有较强的前瞻性。在科技创新能力、行业服务、科研条件建设、国际合作、学术交流等方面均取得较好成绩，完成或超额完成了目标绩效考核任务。经费使用合理规范，无学术不良行为。并对创新工程下一步提出以下建议：

沼气所在创新工程试点期工作的基础上，应进一步优化学科布局，凝练学科方向，创新体制机制，建立和完善科技创新激励机制，大力提升科技创新能力，为行业发展提供良好的科技支撑作用，开创现代农业科研院所建设新格局。不断加强与高等院校、科研院所和相关企业的联合，站在国家层面，针对行业需求进一步凝练研究方向和选题，规划团队发展方向，瞄准科学前沿，做出特色，体现创新解决行业发展的关键问题和技术难题，打造国家沼气高新技术高地，发挥引领作用。各团队要加强沟通与协作，突出优势，努力培养造就高层次的创新型人才队伍。