王锐，副研究员/特聘研究员，厌氧微生物创新团队科研骨干。本科毕业于北京科技大学，博士毕业于中国科学院微生物研究所。

长期从事“古菌/细菌防御—噬菌体反防御”博弈元件的系统性研究，聚焦于新型分子遗传工具的开发与应用。围绕“细菌-噬菌体攻防博弈”这一核心科学问题，系统解析了CRISPR-Cas系统从获得性免疫到基因调控的功能跃迁，揭示了先天群体免疫与获得性免疫的协同机制，提出“协同双重反防御”新概念；原创开发ATTACK耐药菌消杀技术，为耐药菌精准干预、微生物组定向编辑和菌群功能重构等提供了创新思路和工具。以第一或通讯作者（含共同）在Cell Host & Microbe、Nature Chemical Biology、Nature Communications（亮点文章）、Nucleic Acids Research（3篇）等国际期刊发表论文十余篇，申请国内发明专利3件、PCT 1件。

当前研究兴趣：（1）厌氧古菌/细菌与病毒/噬菌体的分子互作机制，发掘产甲烷古菌新型噬菌体资源，解析其宿主识别与裂解的分子基础；探索产甲烷古菌特异性抗病毒防御系统的新元件与新机制。（2）针对重要厌氧底盘菌株的遗传改造需求，构建定制化、高效的基因编辑技术与分子遗传操作平台；围绕厌氧菌群的精准调控需求，开发菌群编辑与基因驱动技术，为甲烷减排、肠道健康等厌氧微生物应用场景提供生物干预策略。

主持/参与的科研项目：

[1] 国家重点研发计划“合成生物学”专项“基于合成微生物组的活体生物药构建与应用”项目（2024YFA0918502），课题2：合成微生物组的工具箱设计与开发，2024.12-2029.11,子课题负责人，80万。

[2] 国家重点研发计划“前沿生物技术”专项“安全、高效工程噬菌体疗法技术开发和临床研究”项目（2025YFC3408400），课题4：细菌耐受噬菌体机制和规避策略研究，2025.06-2028.05,子课题负责人，70万。

[3] 国家自然科学基金面上项目“不动杆菌中新型CRISPR护卫RNA的机制和功能研究”（32270092），2023.01-2026.12，主持，54 万元。

[4] 国家自然科学基金青年科学基金项目“鲍曼不动杆菌I-F型CRISPR-Cas系统获取外源spacer的定点整合机制研究”（31701078），2018.01-2020.12，主持，25 万元。

代表性论文及专利：

[1] Shu Xian#; Wang Rui#*; Li Zhihua#; Xue Qiong#; Wang Jiajun; Liu Jingfang; Cheng Feiyue; Liu Chao; Zhao Huiwei; Hu Chunyi; Li Jie*; Ouyang Songying*; Li Ming*. CRISPR-repressed toxin-antitoxin provides herd immunity against anti-CRISPR elements. Nature Chemical Biology, 21(3):337-347. (2025) 

[2] Wang Rui#; Shu Xian#; Zhao Huiwei#; Xue Qiong; Liu Chao; Wu Aici; Cheng Feiyue; Wang Lingyun; Zhang Yihan; Feng Jie; Wu Nannan; Li Ming*. Associate toxin-antitoxin with CRISPR-Cas to kill multidrug-resistant pathogens. Nature communications, 14(1), 2078. (2023)

[3] Liu Chao#; Wang Rui#; Li Jie#; Cheng Feiyue#; Shu Xian#; Zhao Huiwei; Xue Qiong; Yu Haiying; Wu Aici; WangLingyun; Hu Sushu; Zhang Yihan; Yang Jun; Xiang Hua; Li Ming*. Widespread RNA-based cas regulation monitors crRNA abundance and anti-CRISPR proteins.Cell Host & Microbe, 31(9), 1481-1493. (2023)

[4] Cheng Feiyue#;Wang Rui#; Yu Haiying#; Liu Chao; Yang Jun; Xiang Hua*; Li Ming*; Divergent degeneration of creA antitoxin genes from minimal CRISPRs and the convergent strategy of tRNA-sequestering CreT toxins. Nucleic Acids Research, 49(18), 10677-10688. (2021)

[5] Wu Shuqi#; Xu Run#; Su Mengjiao#; Gao Can; Liu Yang; Chen Yujia; Luan Guangxin; Jia Xu; Wang Rui*; A pyrF-Based Efficient Genetic Manipulation Platform in Acinetobacter baumannii To Explore the Vital DNA Components of Adaptive Immunity for I-F CRISPR-Cas. Microbiology spectrum, 10(5), e0195722. (2022)

[6] Wang Rui#; Li Ming#; Gong Luyao; Hu Songnian; Xiang Hua*; DNA motifs determining theaccuracy of repeat duplication during CRISPR adaptation in Haloarcula hispanica. Nucleic Acids Research, 44(9): 4266-4277.（2016）

[7] Li Ming#;Wang Rui#; Zhao Dahe; Xiang Hua*; Adaptation of the Haloarcula hispanica CRISPR-Cas system to a purified virus strictly requires a priming process. Nucleic Acids Research, 42(4): 2483-2492.（2014）

[8] 李明，王锐，舒宪，程飞跃，杨俊，一种偶联的CRISPR和毒素-抗毒素元件及其在消杀耐药细菌中的应用；申请号：202210947272；申请日期：2022.08.09

[9] Li Ming，Wang Rui，Shu Xian，Cheng Feiyue，CRISPR and toxin-antitoxin element conjugate, and use thereof in killing drug-resistant bacteria；国际申请号：PCT/CN2023/100162，国际申请日：2023.06.14

[10] 李明，赵会伟，王锐，舒宪，基于 CRISPR-Cas偶联毒素-抗毒素系统构建的条件自杀开关及其应用；申请号：2025102161858；申请日期： 2025.02.26  

[11] 李明，王锐，舒宪，基于特异性核酸酶PSN的无毒筛选标记及其在质粒和噬菌体清除中的应用；申请号：2025111755003；申请日期：2025.08.21

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